مطالعه مولکولی، تکاملی و طبقه‌بندی ژن‌های خانواده پروتئین‌های 70 کیلودالتونی شوک گرمایی (Hsp70) در گاو

Authors

جواد احمدپناه دانشجوی کارشناسی ارشد دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران

حمیدرضا سید آبادی عضو هیئت علمی موسسة تحقیقات علوم دامی کشور، تهران

رسول واعظ ترشیزی دانشیار، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران

علی اکبر مسعودی استادیار‌ دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران

میثاق مریدی دانشجوی کارشناسی ارشد دانشکده کشاورزی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران

Abstract:

پروتئین‌های شوک گرمایی (Hsp) به علت ارتباط با صفات مهم اقتصادی در دام‌ها از قبیل مقاومت به تنش گرمایی و ورم پستان دارای اهمیت هستند. در تحقیق حاضر برای آگاهی از روند تکاملی و بررسی ساختار مولکولی ژن‌های خانواده پروتئین‌های 70 کیلودالتونی (Hsp70)، توالی ژنومی آنها در گاو و موجودات دیگر از بانک اطلاعاتی NCBI به دست آمده و مرتب شدند. سپس محاسبه درصد جایگزینی نوکلئوتیدها با یکدیگر، با استفاده از روش حداکثر درست‌نمایی و ترسیم درخت فیلوژنی و تکامل مولکولی به روش neighbor-joining انجام شد. نتایج مطالعات بیوانفورماتیک نشان داد که ژن‌های این خانواده دارای پراکندگی متعدد کروموزومی هستند، که به وجود آورنده نسخه‌های زیادی جهت تظاهر ژنی مورد نیاز برای بروز صفات مرتبط می‌باشند. از طرفی درصد جایگزینی بازهای پیریمیدینی در این خانواده ژنی بسیار بیشتر از میزان جایگزینی بازهای پورینی به پریمیدین و یا پورین می‌باشد. نسبت‌های dN/dS بیان کننده انتخاب خالص و تثبیت آنها در طی تکامل ژن‌های این خانواده می‌باشد. نتایج فیلوژنی نشان می‌دهد که پروتئین‌های خانواده Hsp70 با توجه به مسیر تکاملی خود عمدتاً به دو دسته مجزا تقسیم می‌شوند. در دسته اول پروتئین‌هایb و Hsp70 12a و در دسته دوم دیگر توالی‌های پروتئینی Hsp70 در شاخه‌های متعددی قرار گرفته‌اند.

Upgrade to premium to download articles

Already have an account?login

similar resources

مطالعه مولکولی، تکاملی و طبقه بندی ژن های خانواده پروتئین های 70 کیلودالتونی شوک گرمایی (hsp70) در گاو

پروتئین های شوک گرمایی (hsp) به علت ارتباط با صفات مهم اقتصادی در دام ها از قبیل مقاومت به تنش گرمایی و ورم پستان دارای اهمیت هستند. در تحقیق حاضر برای آگاهی از روند تکاملی و بررسی ساختار مولکولی ژن های خانواده پروتئین های 70 کیلودالتونی (hsp70)، توالی ژنومی آنها در گاو و موجودات دیگر از بانک اطلاعاتی ncbi به دست آمده و مرتب شدند. سپس محاسبه درصد جایگزینی نوکلئوتیدها با یکدیگر، با استفاده از رو...

full text

شناسایی مولکولی ژن تولید کننده پروتئین شوک حرارتی 70 کیلودالتونی در قارچ درماتوفیت ترایکوفایتون وروکوزوم

سابقه و هدف: ترایکوفایتون وروکوزوم (T.verrucosum) یکی از قارچهای درماتوفیت است که پوست و ضمایم آن در انسان و حیوانات به ویژه دام را مورد تهاجم قرار می دهد. در مطالعه حاضر سعی شده است تا پروتئین های کاپرونی منسوب به پروتئین های شوک حرارتی 70 کیلودالتونی در این قارچ تشخیص داده شده و بیان ژن مولد آن تحت شرایط استرس گرمایی بررسی شود.روش بررسی: در این مطالعه تجربی، پرایمرهایی به اندازه 20 یا 21 نوکل...

full text

پروتئین شوک حرارتی 70 کیلودالتونی و دیابت نوع 2

full text

مقایسه‌ی اثر روزه‌داری ماه رمضان و فعالیت ورزشی هوازی منظم بر سطح سرمی پروتئین شوک حرارتی 70 کیلودالتونی (HSP70)، پروفایل لیپیدی و مقاومت انسولینی افراد چاق غیرفعال

مقدمه: هدف از این تحقیق مقایسه اثر روزه داری ماه رمضان (به عنوان یک الگوی رژیمی) و فعالیت ورزشی هوازی منظم بر شاخص های70HSP، نیمرخ لیپیدی و مقاومت انسولینی افراد چاق غیر فعال بود. مواد و روش ها: در این مطالعه 18 مرد چاق 50-40 ساله با نمایه توده بدنی بیش از 30 کیلوگرم متر انتخاب و به دو گروه روزه دار (9=N) و گروه روزه دار و فعالیت ورزشی (9= N) تقسیم شدند. گروه روزه دار و فعالیت ورزشی علاوه بر ر...

full text

بررسی رابطه سطح سرمی لیپوپروتئین با دانسیته کم اکسیده (Oxidized-LDL ) با پروتئین شوک حرارتی 70 کیلودالتونی ( HSP70 ) در بیماران دیابتی نوع 2

full text

همسان‌سازی، تعیین توالی و بیان بخش C ترمینال پروتئین شوک حرارتی 70 ‌(HSP70 )مایکوباکتریوم آویوم تحت گونه پاراتوبرکلوزیس

پروتئین‌های شوک حرارتی (HSPs) در نقش کمک ایمنی باعث افزایش توان پاسخ دستگاه ایمنی ذاتی و اختصاصی بدن نسبت به آنتی ژن‌های مختلـف بـه خصوص آنتی ژن‌های توموری و آنتی ژن‌های عوامل عفونی مختلف می‌شوند. بخش C ترمینال پروتئین شوک حرارتی مایکوباکتریوم توبرکلوزیس در کنار آنتی ژن‌های پروتئینی ساختاری قدرتمند برای تحریک پاسخ‌های ایمنی فراهم می‌آورد. در مورد پروتئین شوک حرارتی 70 متعلق به گونه پاراتوبرکلوز...

full text

My Resources

Save resource for easier access later

Save to my library Already added to my library

{@ msg_add @}

Journal title

علوم دامی ایران

volume 42 issue 2

pages 179- 187

publication date 2011-09-23

unfollow

{@ msg @}

By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.

Keywords

انتخاب توالی فیلوژنی گاو

Hosted on Doprax cloud platform doprax.com